Partizan je u žreb ušao kao 26. ekipa po rejtingu, bio je u četvrtom šeširu, a pre nego što su 'crno-beli' izvučeni određeni su sastavi grupa 'A' i 'B'. Naknadnim žrebom biće određen raspored utakmica u svakoj od grupa. Prvak Srbije dva rivala će dočekati na stadionu u Humskoj, dva puta će igrati kao gost.

Sastav grupa:

grupa A: Šalke 04 (Nemačka), Pari Sen Žermen (Francuska), Mančester Siti (Engleska), Rasing Santander (Španija), Tvente (Holandija)

grupa B: Benfika (Portugalija), Olimpijakos (Grčka), Galatasaraj (Turska), Herta (Nemačka), Metalist Harkov (Ukrajina)

grupa C: Sevilja (Španija), Štutgart (Nemačka), Sampdorija (Italija), Partizan Beograd (Srbija), Standard Lijež (Belgija)

grupa D: Totenhem (Engleska), Spartak Moskva (Rusija), Udineze (Italija), Dinamo Zagreb (Hrvatska), NEC Nijmegen (Holandija)

grupa E: Milan (Italija), Herenven (Holandija), Braga (Portugalija), Portsmut (Engleska), Volfsburg (Nemačka)

grupa F: Hamburger SV (Nemačka), Ajaks (Holandija), Slavija Prag (Češka), Aston Vila (Engleska), Žilina (Slovačka)

grupa G: Valensija (Španija), Klub Briž (Belgija), Rosenborg (Norveška), Kopenhagen (Danska), Sent Etjen (Francuska)

grupa H: CSKA Moskva (Rusija), Deportivo La Korunja (Španija), Fejenord (Holandija), Nansi (Francuska), Leh Poznanj (Poljska)

Utakmice prvog kola igraju se 23. oktobra, drugo je na programu 6, treće 27. novembra. Četvrto kolo igraće se 3. i 4. decembra, peto 17. i 18. decembra, a u šesnaestinu finala plasiraće se tri najbolje ekipe iz svake grupe, uz osam trećeplasiranih iz grupa Lige šampiona.

Finale Kupa UEFA igraće se 20. maja 2009. godine na stadionu "Šukru Saračoglu" u Istanbulu.